WWW.LIB.KNIGI-X.RU
БЕСПЛАТНАЯ  ИНТЕРНЕТ  БИБЛИОТЕКА - Электронные материалы
 

«04 апреля 2014 г. Генетическое разнообразие пород Швейцарских горных и пастушьих собак. В течение осени и зимы 2013-2014, заводчики и энтузиасты собак ...»

04 апреля 2014 г.

Генетическое разнообразие пород Швейцарских горных и

пастушьих собак.

В течение осени и зимы 2013-2014, заводчики и энтузиасты собак породы Бернский

зенненхунд (БЗ) принимали участие в активном изучении генетического разнообразия и состояния

породы посредством комплексного ДНК-тестирования MyDogDNA. Результаты, представленные здесь,

основаны на популяции из 58-ми БЗ, которые были проанализированы к концу марта 2014 года.

Подавляющее большинство протестированных особей БЗ – из Финляндии (42), в том время как российские БЗ составляют еще одну значительную группу (14). Кроме того, было протестировано 10 собак породы Большой швейцарский зенненхунд, 7 собак породы Энтлебухер и 3 собаки породы Аппенцеллер. Данные результаты, также включены в данный отчет.

Технические и методологические подробности о сервисе MyDogDNA были подробно описаны ранее. Для получения дополнительной информации, пожалуйста, обратитесь к http://www.mydogdna.com/sites/default/files/files/mydogdna_technical_sheet.pdf.

1. Состояние генетического разнообразия популяции породы Бернский зенненхунд Рисунок 1 отображает уровень генетического разнообразия пород Бернский зенненхунд и Большой швейцарский зенненхунд, по сравнению с другими собаками в базе данных MyDogDNA.

Данные показатели, также, доступны в интернете по адресу http://www.mydogdna.com/ru/breeds (каждая новая протестированная собака обновляет графики в реальном времени). Текущий средний уровень разнообразия (измеряется как гетерозиготность одиночного нуклеотид-полимоформизма [SNP] всего генома) породы БЗ составляет 24.7% (диапазон 22.4% -26.9%). Для сравнения, этот показатель ниже, чем средний уровень всех собак в базе данных MyDogDNA – 28.8% (диапазон 15.3%



- 40.1%). Статистически значимых различий в уровне разнообразия между финскими и российскими ШЗ не наблюдалось.

Рисунок 1, также, содержит график, иллюстрирующий совместное распределение разнообразия протезированных собак пород Швейцарских горных и пастушьих собак в целом. Эта кривая еще раз подтверждает, что разнообразие породной группы (среднее значение 24.1%, диапазон 17.3% -26.9%) – ниже, чем средний уровень всех собак в базе данных MyDogDNA. Все вышеперечисленные расчетные значения приведены в Таблице 1. Обратите внимание, что представленные значения для других пород, кроме БЗ, основаны на очень ограниченном количестве собак, т.е. они, пока, не обеспечивают полной картины состояния пород.

GENOSCOPER LABORATORIES | P.O. BOX 162 FI-00380 Helsinki Finland | Tel. +358 50 3678 282 | info@mydogdna.com 04 апреля 2014 г.

Рисунок 1. Распределение разнообразия Швейцарских горных и пастушьих собак.

Синяя линия представляет собой сглаженную гистограмму генетического разнообразия (измеряется как соотношение гетерозиготности SNP [одиночного нуклеотид-полимоформизма] всего генома) породы Бернский зенненхунд (58 особей). Для справки, оранжевая линия отображает текущее распределение всех протестированных в базе данных MyDogDNA вне зависимости от породы. Зеленая линия отображает уровень разнообразия всех протестированных Швейцарских горных и пастушьих собак в качестве комбинированной породной группы.

Перевод Dog population – Популяция собак Genetic diversity (heterozygosity, %) – Генетическое разнообразие (гетерозиготность, %) Bernese Mountain Dog (30-100 tested dogs), Median: 24.7% - Бернский зенненхунд (протестировано 30-100 собак), Среднее значение: 24.7% Swiss Mountaing and Cattle Dogs, Median: 24.1% (Appenzell Cattle Dog, Bernese Mountain Dog, Entlebucher Mountain Dog, Great Swiss Mountain Dog) - Швейцарские горные и пастушьи собаки, Среднее значение: 24.1% (Аппенцеллер зенненхунд, Бернский зенненхунд, Энтлебухер зенненхунд, Большой швейцарский зенненхунд) All dogs, Median: 28.8% - Все собаки, Среднее значение: 28.8%

–  –  –

Таблица 1. Уровни разнообразия Швейцарских горных и пастушьих собак, основанные на SNP (одиночный нуклеотид-полимоформизм) всего генома.

Значения гетерозиготности других пород собак, кроме Бернского зенненхунда, представлены только в качестве примера, т.к. для получения полной картины о их состоянии разнообразия должно быть протестировано большее количество собак.

–  –  –

2. Генетические связи породы Бернский зенненхунд Генетическая структура породы, или генетические сходства и различия между особями могут быть визуализированы при помощи стандартного многомерного скейлинг-анализа (MDS). Для того, чтобы отобразить двухмерный точечный график, который поддерживает исходные, возможные для интерпретации, генетические расстояния между отдельными особями, мы используем измерения на основе анализа MDS. Подобная визуализация может быть использована для выявления генетически различных линий разведения в пределах популяции (например, в связи с географическими различиями или генетическими расхождениями, вызванными скрещиваниями между шоу- и рабочими линиями). Это может помочь оценить, какие собаки могут быть повязаны для сохранения генетического разнообразия в пределах линии, а также в пределах породы в целом. Рисунок 2 представляет собой визуализацию MDS изучаемой популяции БЗ, а Рисунок 3 уже включает в себя всех Швейцарских горных и пастушьих собак. Владельцы могут видеть всех своих собак на одном графике.

С каждой новой протестированной собакой, которая добавляется в базу данных MyDogDNA, участки графиков автоматически изменяются.

Рисунок 2. Генетические связи породы Бернский зенненхунд.

Каждая отдельная собака представлена точкой многомерного скейлинг-графика. Собаки, которые находятся близко друг к другу имеют подобные геному, в то время как собаки, расположенные далеко друг от друга, генетически отличаются друг от друга. На GENOSCOPER LABORATORIES | P.O. BOX 162 FI-00380 Helsinki Finland | Tel. +358 50 3678 282 | info@mydogdna.com 04 апреля 2014 г.

данном конкретном графике, собаки из России были окрашены в фиолетовый цвет, а остальные, обозначенные синими точками, почти все, являются собаки из Финляндии. И, хотя, российские собаки имеют тенденцию группироваться вместе, явно видны пересечения в генетической идентичности с финской популяцией. Следует отметить, что цвет точек основан лишь на данных о стране владельцев собак, и поэтому происхождение импортируемых собак не может быть учтено полностью.

Перевод Genetic relationships – Генетические связи Рисунок 3. Генетические связи Швейцарских горных и пастушьих собак. Четкие генетические тождества выявлены для каждой из четырех проанализированных пород собак.

Перевод Genetic relationships – Генетические связи Swiss Mountaing and Cattle Dogs (Appenzell Cattle Dog, Bernese Mountain Dog, Entlebucher Mountain Dog, Great Swiss Mountain Dog) Швейцарские горные и пастушьи собаки (Аппенцеллер зенненхунд, Бернский зенненхунд, Энтлебухер зенненхунд, Большой швейцарский зенненхунд) В частности, анализ генетических связей Бернских зенненхундов выявил некоторые потенциальные кластеры, которые, возможно, представляют линии различных заводчиков. При нынешнем размере выборки, эти генетические различия выделятся более четко, чем географические различия между финскими и российскими собаками. Поскольку, все больше собак будет протестировано посредством MyDogDNA в будущем, могут проявиться потенциальные географические и другого рода различия. В целом, понимание генетических различий, которые присутствуют между собаками одной породы поможет идентифицировать оптимальных для селекции партнеров (для максимально генетически разнообразного потомства).

Именно для подобных целей, сервис MyDogDNA включает в себя пользовательский инструмент под названием MyDogDNA Breeder™, который для владельце протестированных собак GENOSCOPER LABORATORIES | P.O. BOX 162 FI-00380 Helsinki Finland | Tel. +358 50 3678 282 | info@mydogdna.com 04 апреля 2014 г.

бесплатно. Этот инструмент использует измеренные генетические данные для идентификации племенных партнеров, которые генетически различаются от собственной собаки пользователя, и не несет таких же наследственных нарушений, тесты на которые содержаться в тестовой панели MyDogDNA. Другими словами, MyDogDNA Breeder™ выдает рейтинг потенциальных партнеров в соответствии с ожидаемым уровнем генетического здоровья и разнообразия потомства. Он, также, отображает географическое расположение потенциальных партнеров и предлагает прямой способ для связи с владельцем интересующей собаки через базу данных MyDogDNA. На момент публикации данного отчета уже 73% владельцев протестированных Швейцарских горных и пастушьих собак дали свое согласие на участие в поиске MyDogDNA Breeder™, что делает его перспективным инструментом для поддержки будущих усилий по повышению генетического разнообразия.





3. Протестированные генетические нарушения В дополнение к анализу разнообразия, тестовая панель MyDogDNA включает в себя скрининг около 100 генетических мутаций, как известно, которые являются причиной наследственных заболеваний (http://www.mydogdna.com/ru/%D0%BF%D0%BE%D1%80%D0%BE%D0%B4%D1%8B/217/bernesemountain-dog).

В проанализированной группе Швейцарских горных и пастушьих собак:

- Среди Бернских зенненхудов были найдены носители Дегенеративной миелопатии (DM), мутация SOD1. Это прогрессирующее нейродегенеративное заболевание с поздним началом, найденное в нескольких различных породах. Заболевание характеризуется потерей белого вещества спинного мозга. Онo имеет аутосомно-рецессивный механизм наследования с неполной пенетрацией.

Результаты говорят о том, что данное нарушение несет 47% (5 из 10) протестированной популяции.

- Среди Больших швейцарских зенненхундов были найдены носители известного Нарушение свертываемости крови по причине дефекта в гене P2RY12. Больные собаки страдают от чрезмерного кровотечения после травмы или операции. Тип наследования - аутосомно-рецессивный. Мутация, которая лежит в основе дефекта P2Y12 была обнаружена в одной популяции Больших швейцарских зенненхундов в 2011 году, но по прогнозам, будет довольно широко распространено в породе (Boudreaux et al. 2011, Vet Clin Pathol 40:202-206). Хотя размер нашей выборки, пока, не является показательной для всей породы, но уже сейчас данные подтверждают этот прогноз – 80% (8 из 10) протестированных собак несут дефект P2Y12. Подобная частота может быть результатом сильного генетического узкого «бутылочного горлышка», вызванного попытками восстановления породы в начале 1900-х.

Селекционеры, все же, не советуют исключать носителей из разведения. Частота мутации в популяции может быть уменьшена путем вязки «носителей» с «генетически здоровыми» особями в течение нескольких поколений, в долгосрочной перспективе.

Выводы Данная оценка генетического разнообразия Швейцарских горных и пастушьих собак предполагает, что, как группа, анализируемые породы генетически несколько менее разнообразны, чем породы собак в среднем. Мы призываем заводчиков и энтузиастов породы продолжать GENOSCOPER LABORATORIES | P.O. BOX 162 FI-00380 Helsinki Finland | Tel. +358 50 3678 282 | info@mydogdna.com 04 апреля 2014 г.

исследование ситуации путем расширения выборки протестированных собак из разных стран мира.

База данных MyDogDNA обновляется в режиме реального времени и, по-прежнему, будет источником наиболее точного представления о состоянии разнообразия породы, а также о любом прогрессе в этом направлении.

В частности, мы призываем тестировать больше собак пород Большой швейцарский зенненхунд, Энтлебухер зенненхунд и Аппенцеллер зенненхунд. Наши предварительные результаты говорят о том, что состояние генетического разнообразия этих пород находится на уровне даже ниже, чем Бернский зенненхунд. Данный факт требует тщательного изучения и усилий к стремлению увеличить генетическое разнообразие, чтобы избежать последствий инбридинга. Впервые, современные инструменты биоинформатики, также, могут быть использованы в помощь для идентификации действительно генетически различных особей и выбора оптимальных пар для устойчивого разведения. Уникальная система MyDogDNA Breeder™, как ожидается, станет отличным инструментом поддержки этих усилий.

Наконец, наши исследования и знания мутаций, лежащих в основе наследственных заболеваний показало высокую частоту носителей Дегенеративной миелопатии у собак породы Бернский зенненхунд и Нарушения свертываемости крови по причине дефекта в гене P2RY12 у собак породы Большой швейцарский зенненхунд. Для того чтобы обеспечить полноценный уход, владельцы и заводчики собак должны заранее обладать информацией о существующих генетических нарушениях.

Комплексное ДНК-тестирование на наследственные заболевания доступно как часть сервиса MyDogDNA.

Похожие работы:

«ИНФОРМАЦИЯ БАНКА "ЙОШКАР-ОЛА" (ПАО) по стандартной программе кредитования "Автокредит" подпрограмма "Автокредит с условием страхования КАСКО" Наименование кредитной организации: Банк "Йошкар-Ола" (публичное акционерное общество), ИНН 1215059221, ОГРН 1021200004748. Лицензия на совершение банковских № 2802, в...»

«1 Мастер-план "Чистый воздух для Мариуполя" Отчет проф. Михаэль Шмидт проф. Алексей Капустин Тамара Венцова Мариуполь, 15.01.2015 СОДЕРЖАНИЕ 1. Введение 2. Обзор "Программ по охране и оздоровлению окружающей среды Мариуполя" 1998-2008, 2006-2010 и 2012-2020 гг 3. Цели проекта и обзор...»

«Информация об АНТКОМ и его связях с Договором об Антарктике КОНВЕНЦИЯ АНТКОМ И ДОГОВОР ОБ АНТАРКТИКЕ 1. Конвенция о сохранении морских живых ресурсов Антарктики (Конвенция АНТКОМ) берет свое начало в Договоре о...»

«IES-1248 IP DSL-коммутатор с поддержкой ADSL2+ Руководство пользователя 5/2005 Версия 3.50(LS.0), (TR.0) Руководство пользователя IES-1248 Авторские права Авторские права принадлежат ZyXEL Communications Corporation, © 2005 Сведения, содержащиеся в наст...»

«147 УДК 620.179.14 ОБРАБОТКА МАГНИТОМЕТРИЧЕСКОЙ ИНФОРМАЦИИ ПРИ ДИСТАНЦИОННОЙ ДИАГНОСТИКЕ ПОДЗЕМНЫХ СТАЛЬНЫХ ТРУБОПРОВОДОВ Коннов В. В. ЗАО Научно-производственный центр "МОЛНИЯ", г. Москва e-mail:molkon@bk.ru Аннотация. Для обработки магнитометрических сигналов при дистанционн...»

«Владимир Бондаренко Тайцзицюань семьи Ян: стиль внутренних покоев Весь мир практикует тайцзицюань семьи Ян в передаче Ян Чэнфу, и многие наслышаны, что тайцзицюань не только оздоровительное искусство, но и искусство боя. Но возникает вопрос, как удалось Ян Лучаню получить прозвище Ян уди (Ян не имеющий противников), практикуя только 1 компле...»

«2 ГИТАРНЫЙ ПРЕДВАРИТЕЛЬНЫЙ УСИЛИТЕЛЬ www.amtelectronics.com West Siberia Russia Omsk Take your rig to another level! Legends references: S2 Soldano SLO100 D2 Diezel O2 Orange Ad30 P2 Peavey 5150 C2 Cornford Carrera E2 Engl K2 Krank R2 Mesa Rectifier B2 Bogner Extazy M2 Marshall JCM800 Vt2 VHT Names used in t...»

«Котик Ольга Сергеевна ТИПЫ ОРГАНИЧЕСКОГО ВЕЩЕСТВА И ГЕНЕРАЦИОННЫЙ ПОТЕНЦИАЛ ПЕРМСКИХ УГЛЕНОСНЫХ ОТЛОЖЕНИЙ КОСЬЮ-РОГОВСКОЙ ВПАДИНЫ Специальность 25.00.12 – Геология, поиски и разведка нефтяных и газовых месторождений Диссертация на соискание ученой степени кандидата геолого-минералогических наук...»

«ПРАВИТЕЛЬСТВО АМУРСКОЙ ОБЛАСТИ ПОСТАНОВЛЕНИЕ от 25 сен тября 2013 г. N 450 ОБ УТВЕРЖДЕНИИ ГОСУДАРСТВЕННОЙ ПРОГРАММЫ АМУРСКОЙ ОБЛАСТИ РАЗВИТИЕ ТРАНСПОРТНОЙ СИСТЕМЫ АМУРСКОЙ ОБЛАСТИ НА 2014 2020 ГОДЫ Список изменяющих документов (в ред. постановлений Правительства Амурской области от 23.01.2014 N 18, от 30.01.2014 N 49, от...»










 
2017 www.lib.knigi-x.ru - «Бесплатная электронная библиотека - электронные материалы»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.